提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
高铁香港段1月15日恢复服务 每日售票上限1万张******
中新社香港1月12日电 (记者 韩星童)在停运三年后，高铁香港段将于1月15日恢复服务。香港特区政府运输及物流局局长林世雄12日公布，高铁复通初期将恢复部分短途服务，每日售票上限为1万张。港铁公司随后补充指，高铁短途复通后新增3个站点，将全面引入票务电子化。
1月11日，广东省广州市，一列由香港西九龙站始发的高铁列车抵达广州南站。 中新社记者 陈骥旻 摄林世雄表示，高铁复通初期将恢复往来香港西九龙站至福田、深圳北及广州南站点的短途服务。恢复营运初期，为确保高铁服务顺畅及稳妥，每日出售车票上限为1万张，北行和南行各5000张。他提到，特区政府会即时检视需求和站内运作情况，适时研究陆续增加车票出售。
林世雄提到，在高铁香港段服务暂停的三年间，香港西九龙站附近有了许多新景点，比如M+、香港故宫文化博物馆等，相信这些地方都将增加高铁服务的吸引力。
港铁公司香港客运服务总监杨美珍表示，高铁香港段复通后，将新增3个短途站点，包括东莞南站、东莞站、广州东站。增加后，高铁香港段将连接全中国61个站点。她认为，增加广州东这一新站点，标志着高铁短途网络打通一个非常重要的连接点，它将与广州南站相辅相成，进一步深化粤港澳大湾区的互联互通。
资料图 高铁时代的香港“春运”。中新社记者 洪少葵 摄此外，杨美珍表示，香港西九龙站全面引入电子车票，将不再有纸质车票，让运作更智能化、乘车流程更简单、顺畅。
据悉，电子车票将与乘客旅游证件资料连接，乘客凭证件即可入闸搭车，乘客可通过中国铁路官方网上购票系统12306、站内票务柜台及售票机，或指定代理等多渠道购买车票。为了配合新的票务电子化安排，港铁公司对香港西九龙站进行重新布局，并提升设备，设置了10条自助通道及6条职员辅助通道，入闸设施较以往多一倍。
杨美珍透露，香港西九龙站将于12日下午2时开放予乘客购买车票，港铁公司会继续跟内地铁路单位保持沟通，商讨逐步恢复高铁的中长途列车安排，全力支持香港和内地逐步有序恢复两地人员正常往来。(完)
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